经常会听到一些人说，既然益生菌的功能那么强大，益生菌那么好，那每天补充益生菌就好了，是医院，再吃抗生素了？
当然不是这样，益生菌虽好，但是大家切不可进入误区。
益生菌是一类对宿主有益的活性微生物，常被用于改善肠道，阴道，菌群平衡，提升人体免疫。而抗生素是微生物的一种代谢产物，它对致病微生物有抑制和灭杀的作用。所以说，益生菌作用在预防，温和改善；而抗生素作用在治疗，直接有效。
虽说抗生素对细菌有很明显的抑制灭杀作用，但正是这杀灭作用，也带来了一定的负面影响，抗生素在杀菌时，不具有选择性，在杀死有害菌的同时，也消灭了有益菌。而且抗生素的副作用也很明显，过多服用它会破坏人体免疫系统等。而益生菌是能通过压制坏菌来恢复身体机能，只杀死坏菌，不会对好菌有影响。
通常情况下，用高剂量抗生素治疗两周后，肠道内绝大多数普通微生物都会被杀死。在停药一周后，肠道菌群才逐步恢复，但是益生菌的生长速度比其他细菌慢得多，肠道的菌群和健康时完全不同。（婴幼儿，儿童使用抗生素后会停止一周生长发育）。抗生素对某些细菌无能为力，残存的细菌和其他大量细菌一起争夺有限营养，导致菌群不平衡，影响人体健康。由于正常菌群的敏感菌受到抑制或者杀灭，使得耐药细菌，如葡萄球菌等失去其他细菌的抵制和制约，趁机大量繁殖，造成肠道细菌群乱。可通过补充益生菌的方法，对肠道菌群进行调节，恢复肠道菌群平衡。
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